针对您的进一步疑问，如果三方协议中有一方未签字但已经履行了主要义务，并且其他两方接受了这种履行，那么根据《民法典》第四百九十条的规定，该三方协议是有效的。这是因为，尽管形式上存在未签字的情况，但实际上各方已通过行为表明了对协议的认可和接受，形成了事实上的合同关系。
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从法律角度看，三方协议在以下情况下会被视为无效：一是协议内容违反法律、行政法规的强制性规定；二是协议存在欺诈、胁迫等情形，损害国家利益或社会公共利益；三是协议主体不具备相应的民事行为能力；四是协议未经三方共同签字或盖章，且未履行主要义务或未被其他方接受。
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在三方协议签字不全时，判断协议是否有效的具体操作包括：首先，检查是否有未签字的一方已经履行了主要义务；其次，确认其他两方是否接受了这种履行；最后，若满足上述条件，则可依据《民法典》第四百九十条的规定，认定协议有效。